プロテインSはビタミンK依存性の血漿糖タンパク質です。血中を循環するタンパク質は、遊離型(40%)と補体C4成分に結合した型(60%)の2つの形態をとります。これらは動的平衡状態にありますが、活性を示すのは遊離型タンパク質のみです。プロテインSは、VaおよびVIIIa血液凝固因子の不活性化過程において、プロテインCの補因子として機能します。
プロテインCは、血漿中のビタミンK依存性糖タンパク質です。肝臓で不活性型プロ酵素として合成され、トロンビン-トロンボモジュリン複合体の影響を受けて活性型に変換されます。活性化プロテインCは抗凝固酵素であり、イオン化カルシウム、リン脂質、および補因子であるプロテインSの存在下でVa因子およびVIIIa因子を加水分解することにより、選択的に不活性化します。これにより、プロトロンビンからトロンビンへの変換が阻害されます。