喀痰の微生物学的検査

微生物学的検査は、肺炎の原因物質の診断的探索と検証において最も重要な段階です。原因物質の分離だけでなく、殺菌作用や静菌作用を持つ様々な薬剤に対する感受性など、その特性を調べることも含まれます。

この目的のために、様々な栄養培地への喀痰播種法が用いられます。検査室に持ち込まれた喀痰サンプルから膿性塊を選別し、塩化ナトリウム同位体溶液を用いてペトリ皿で丁寧に洗浄します。これにより、ある程度、上気道の微生物叢から除去することができます。膿性喀痰塊の播種は、微生物学の専門マニュアルに記載されている組成の様々な栄養培地で行われます。播種した培地は37.5℃で24時間培養します。増殖したコロニーから純粋培養物を分離し、既知の微生物学的方法によって同定し、抗生物質に対する感受性を決定します。

微生物の定量的含有量を測定するために、喀痰をホモジェナイズし、栄養培地と混合した後、10倍希釈液を調製し、血液寒天培地を入れたペトリ皿に接種する。37.5℃で24時間培養した後、外観上同じ種類のコロニーを数え、希釈度を考慮して結果を検討する。コロニーから塗抹標本を作製し、顕微鏡で観察する。

結果の解釈

喀痰の微生物学的検査結果の解釈は非常に複雑であり、これには多くの要因が関係しています。上気道および口腔の微生物叢が気管支内容物に常に散布されていること、そして健康な人の正常な気管支内容物には、呼吸器疾患の最も一般的な原因菌（肺炎球菌、連鎖球菌、ブドウ球菌など）のほとんどが頻繁に存在することについては、既に既に述べました。この点において、微生物学的検査において、喀痰中に様々な微生物群（この場合はほとんどが日和見感染性）が分離されることは、疾患の原因菌を特定することを極めて困難にします。したがって、喀痰の微生物学的検査結果を解釈するには、特定の種類の細菌の量的優位性（10 ⁶ -10 ⁷ mc/ml以上）、増悪期における特定の微生物の出現、そして寛解期におけるそれらの消失を考慮する必要があります。疾患の臨床像を考慮することは非常に重要です。

肺炎の様々な臨床形態の主な原因物質および可能性のある原因物質

肺炎の臨床的形態	主な病原体	可能性のある病原体
クループス	肺炎球菌	連鎖球菌、クレブシエラ
インフルエンザ後	ブドウ球菌、肺炎球菌、クレブシエラ菌	インフルエンザ菌、連鎖球菌
膿瘍	ブドウ球菌、バクテロイド、混合菌叢	クレブシエラ、緑膿菌
願望	バクテロイデス、嫌気性連鎖球菌	ブドウ球菌、肺炎球菌
術後	ブドウ球菌	肺炎球菌、クレブシエラ
インタースティシャル	マイコプラズマ	鳥類症、オウム病の病原体
抗菌薬治療を受けていない入院患者における二次性肺炎	ブドウ球菌、肺炎球菌、クレブシエラ、バクテロイデス	大腸菌、セラチア菌など
抗菌療法を背景に二次性肺炎が発症した	通性病原微生物	シュードモナス、セラチア、クレブシエラ、ブドウ球菌、プロテウスなど。
慢性気管支炎の患者	肺炎球菌、インフルエンザ菌	ブドウ球菌、連鎖球菌
アルコール依存症患者の場合	肺炎球菌、インフルエンザ菌、クレブシエラ菌	大腸菌、原生動物
後天性免疫不全症候群では	ニューモシスチス、真菌	サイトメガロウイルス
外部の医療提供者がケアを提供する患者の場合	肺炎球菌、ブドウ球菌、血友病乳頭	クレブシエラ、大腸菌

肺炎患者における微生物汚染検査の結果を定量的に評価する際には、この指標が抗生物質の処方に対して非常に高い感受性を持つことを念頭に置く必要があります。抗菌薬による短期的な治療でさえ、微生物汚染が急激に減少する可能性があり、喀痰検査の結果を適切に評価することはできません。したがって、抗生物質治療を処方する前に喀痰を採取することをお勧めします。

また、肺炎の細胞内病原体（マイコプラズマ、レジオネラ、クラミジア、リケッチア）の培養には、特殊な選択栄養培地が用いられることにも留意すべきである。従来の栄養培地（寒天培地）を用いた通常の微生物学的検査では、陽性反応は得られない。したがって、微生物学的検査の具体的な方法の選択は、主治医の協力を得て行うべきであり、主治医は、この患者の肺炎発症における細胞内病原体の役割の可能性について、検査医に疑念を伝える義務がある。

実際の臨床現場では、喀痰の微生物学的検査を技術的に完璧に実施しても、病原体を特定できるのは40～60%に過ぎないことを付け加えておくべきである。したがって、病原体の確認には、他の現代的な研究手法を用いることもできる。細菌学的検査の情報量は、喀痰ではなく、気管支吸引液、気管支肺胞洗浄（BAL）、気管支鏡検査などで採取した体液を用いることで、大幅に増加する。

さらに、様々な生物学的材料（気管支鏡検査材料、血液、胸膜内容物など）を用いた免疫蛍光法、PCR診断法、血清中の特異抗体レベルの研究などによって、肺炎病原体の同定が可能です。残念ながら、これらの診断法はまだ広く臨床応用されておらず、現在は大規模な専門センターや研究室でのみ使用されています。

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