IgM抗体は感染の急性期(発症後5日目)に検出されます。IgM抗体のピークは1~2週間目に現れ、その後徐々に抗体価が低下します(通常、治療を行わなくても2~3ヶ月で消失します)。IgM抗体は、クラミジアの外膜を構成するリポ多糖体と主要タンパク質を標的としています。
ライム病では、特異的IgM抗体は通常、遊走性紅斑の発症から2~4週間後に血中に出現し、抗体のピークは発症後6~8週間で現れます。ステージ1では、患者の40~60%でIgM抗体が検出されます。